Khác biệt giữa bản sửa đổi của “Metagenomics”
Nội dung được xóa Nội dung được thêm vào
đa dạng loài |
|||
Dòng 137:
===Metatranscriptomics===
{{Further|Transcriptome}}
Với Metagenomics các nhà khoa học có thể tìm hiểu được đa dạng chức năng và trao đổi chất của quần xã vi sinh, nhưng không thể biết được quá trình nào trong số đó đang diễn ra.<ref /> Nhờ tách chiết và phân tích metagenomic mRNA (còn gọi là '''metatranscriptome''') mà có thể biết được đặc tính điều hòa và biểu hiện của hệ quần xã. Do các khó khăn kỹ thuật (vd. như thời gian bán rã ngắn (short half-life) của mRNA) trong thu thập RNA môi trường mà hiện nay các nhà khoa học đã phát triển một số nghiên cứu metatranscriptomic in situ.<ref /> Và cũng không chỉ giới hạn trong kỹ thuật microarray, đến nay nghiên cứu metatranscriptomic cũng đã ứng dụng giải trình tự cDNA theo phương pháp hiện đại để xác định biểu hiện của toàn bộ genome và định lượng quần xã vi sinh. <ref /><ref />
Metagenomics allows researchers to access the functional and metabolic diversity of microbial communities, but it cannot show which of these processes are active.<ref name="simon2011" /> The extraction and analysis of metagenomic [[mRNA]] (the '''metatranscriptome''') provides information on the [[Gene regulation|regulation]] and [[Gene expression|expression]] profiles of complex communities. Because of the technical difficulties (the [[MRNA#Degradation|short half-life]] of mRNA, for example) in the collection of environmental RNA there have been relatively few ''[[In situ#Biology|in situ]]'' metatranscriptomic studies of microbial communities to date.<ref name="simon2011" /> While originally limited to [[DNA microarray|microarray]] technology, metatranscriptomcs studies have made use of direct high-throughput [[cDNA]] sequencing to provide whole-genome expression and quantification of a microbial community,<ref name="simon2011" /> as first employed by Leininger ''et al.'' (2006) in their analysis of ammonia oxidation in soils.<ref name="leininger2006" />
===Metagenomics với virus===
| |||