Vào [[tháng 7]] năm [[1940]], nó bị tai nạn va chạm với chiếc tàu buôn AMC Corfu và được sửa chữa tại [[Simonstown]], [[Nam Phi]]. Sau khi việc sửa chữa hoàn tất, nó tiếp tục nhiệm vụ tuần tra, nhưng lần này là tại [[Ấn Độ Dương]] trong thành phần của [[Hạm đội Viễn Đông Anh Quốc|Hạm đội Viễn Đông]].
[[Tập tin:HermesSinking.jpg|nhỏ|trái|''Hermes'' đang bị chìm sau đợt không kích của Nhật vào ngày [[9 tháng 4]] năm [[1942]].]]
Trong trận [[không kích Ấn Độ Dương (1942})|Không kích Ấn Độ Dương]], ''Hermes'' đang được sửa chữa tại cảng [[Trincomalee]] thuộc [[Ceylon]] (ngày nay là [[Sri Lanka]]). Sự cảnh báo sớm đưa ra từ hệ thống giải mã Ultra về cuộc tấn công của quân Nhật đã giúp cho nó rời khỏi cảng kịp lúc và tránh được đợt không kích thứ nhất, nhưng vào ngày [[9 tháng 4]] năm [[1942]], nó bị một máy bay trinh sát Nhật Bản phát hiện khi đang ngoài khơi [[Batticaloa]]. Không có các máy bay của chính mình, chiếc tàu sân bay không thể tự vệ khi bị 50 [[máy bay ném bom bổ nhào]] [[Aichi D3A]]1 “Val” từ các tàu sân bay [[Akagi (tàu sân bay Nhật)|''Akagi'']], [[Hiryu (tàu sân bay Nhật)|''Hiryu'']] và [[Soryu (tàu sân bay Nhật)|''Soryu'']] tấn công. Bị đánh trúng khoảng 40 lần, ''Hermes'' chìm với tổn thất 307 người. Những tàu hộ tống của nó bao gồm [[tàu khu trục]] [[HMAS Vampire (D68)|HMAS ''Vampire'']] và [[tàu hộ tống nhỏ]] [[HMS Hollyhock (K64)|''Hollyhock'']] cùng hai tàu chở dầu cũng bị đánh chìm. 590 người sống sót sau cuộc tấn công được tàu bệnh viện ''Vita'' vớt lên và đưa về [[Colombo]].
Xác tàu đắm của chiếc ''Hermes'' nằm tại Ấn Độ Dương ngoài khơi [[Batticaloa]], [[Sri Lanka]].
