Cũng có nhiều dự án khác nhau được đề nghị để di chuyển các cơ quan chức năng của nhà nước từ Tokyo đến một thủ đô thứ hai ở một vùng khác của Nhật Bản, để làm giảm đi sự phát triển nhanh chóng ở Tokyo và vực dậy những vùng chậm phát triển về mặt kinh tế. Những dự án này còn nhiều tranh cãi trong Nhật Bản và chưa được thực hiện.
hảmThảm họa[[Động đất và sóng thần Tōhoku 2011| động đất và sóng thần]] năm 2011 tàn phá phần lớn bờ biển đông bắc của Honshu đã có thể cảm nhận được ở Tokyo. Tuy nhiên, do cơ sở hạ tầng kháng động đất của Tokyo rất tốt, thiệt hại ở Tokyo là rất nhỏ so với các khu vực trực tiếp bị ảnh hưởng bởi sóng thần<ref>{{Chú thích web|url=http://inhabitat.com/despite-record-breaking-earthquake-no-buildings-in-tokyo-collapsed-thanks-to-stringent-building-codes/|tiêu đề=Despite Major Earthquake Zero Tokyo Buildings Collapsed Thanks to Stringent Building Codes|ngày truy cập=October 11, 2011}}</ref> mặc dù hoạt động trong thành phố phần lớn đã bị dừng lại.<ref>{{Chú thích báo|tên bài=Japan earthquake disrupts Tokyo, leaves capital only lightly damaged|địa chỉ=http://articles.latimes.com/2011/mar/11/world/la-fgw-japan-quake-tokyo-20110311}}</ref> cuộcCuộc [[Sự cố nhà máy điện Fukushima I|khủng hoảng hạt nhân]] gây ra bởi những cơn sóng thần cũng không khiến Tokyo bị thiệt hại gì đáng kể, bất chấp sự gia tăng đột ngột về mức độ bức xạ.<ref>{{Chú thích web|url=http://metropolis.co.jp/quake/quake-2011-03/tokyo-radiation-levels-historical/|tiêu đề=Tokyo Radiation Levels- Metropolis Magazine|ngày truy cập=April 25, 2012}}</ref><ref>{{Chú thích web|url=http://chottomatte.net/2011/04/01/tokyo-radiation-levels-daily-updates-april/|tiêu đề=Tokyo radiation levels – daily updates – April|ngày truy cập=October 11, 2011|url lưu trữ=https://web.archive.org/web/20110819194046/http://chottomatte.net/2011/04/01/tokyo-radiation-levels-daily-updates-april/|ngày lưu trữ=August 19, 2011|url hỏng=yes}}</ref>
Vào ngày 7 tháng 9 năm 2013 Tokyo dã được chọn làm chủ nhà của Olympic mùa hè 2020. Tokyo sẽ là thành phố châu Á đầu tiên đăng cai Thế vận hội hai lần.<ref>{{Chú thích web|url=http://www.olympic.org/tokyo-2020-summer-olympics|tiêu đề=IOC selects Tokyo as host of 2020 Summer Olympic Games|ngày truy cập=October 10, 2014}}</ref>
