Khác biệt giữa bản sửa đổi của “Metagenomics”
Nội dung được xóa Nội dung được thêm vào
n →Bước đầu sàng lọc trình tự: AlphamaEditor, Excuted time: 00:00:19.0070000 |
|||
Dòng 191:
</ref>, từ đó có thể hiểu rõ hơn về sinh thái học và so sánh các mẫu môi trường với nhau.
Bên cạnh đó có thể dùng Shotgun metagenomic để giải trình tự gần như hoàn toàn hệ gen của vi sinh vật trực tiếp từ môi trường.<ref name="Tyson2004" /> Phân tích DNA của một mẫu thường cho kết quả là dữ liệu DNA của vi sinh vật có nhiều nhất trong mẫu. Để có được cái nhìn toàn diện hơn ta cần tìm cách giải trình tự bộ gen của các thành viên khác trong quần xã bằng cách phân tích một lượng mẫu lớn. Với giải trình tự shotgun ngẫu nhiên ta có thể phát hiện được các thành viên này ngay chỉ với các đoạn trình tự vô cùng nhỏ bé.<ref name="Tyson2004" />
===Giải trình tự hiện đại (High-throughput sequencing)===
Hàng 238 ⟶ 240:
| url = http://www.nap.edu/catalog/11902.html
}}
</ref>
===Bước đầu sàng lọc trình tự===
Hàng 319 ⟶ 323:
| pmc = 2896542
}}
</ref> và GLIMMER phục vụ cho hướng thứ hai. Ưu điểm đầu tiên của dự đoán ''ab initio'' là nó cho phép dò các vùng mã hóa không có homolog tương đồng trên ngân hàng dữ liệu, tuy nhiên để phương pháp này thật chính xác thì cần có những đoạn DNA đủ lớn để so sánh.<ref name="wooley2010"/>
===Đa dạng loài===
Hàng 362 ⟶ 368:
* [http://metagenomics.anl.gov/ MG-RAST] Metagenomics Rapid Annotation using Subsystem Technology server
* [http://books.nap.edu/catalog.php?record_id=11902 The New Science of Metagenomics: Revealing the Secrets of Our Microbial Planet] A report released by the National Research Council in March 2007. Also, see the [http://dels.nas.edu/dels/rpt_briefs/metagenomics_brief_final.pdf Report In Brief.]
*
{{Genomics}}
| |||