Ông là người làng Bái Giao, huyện [[Đông Sơn]] (nay thuộc xã Thiệu Giao, huyện [[Thiệu Hóa]]) tỉnh [[Thanh Hóa]]. Đỗ Cử nhân vào thời [[Tự Đức]], nhưng ông không ra làm quan.
Sau [[tháng 7]] năm [[1885]], hưởng ứng [[phongChiếu tràoCần Vương|dụ Cần Vương]] bùng nổ, Lê Khắc Tháo mộ quân ứng nghĩa chống Pháp, được cử giữ chức Tán tương quân vụ trong [[phong trào Cần Vương]] ở [[Đông Sơn, Thanh Hóa|Đông Sơn]] ([[Thanh Hóa]]). [[Tháng 2]] năm [[1886]]<ref> Thời điểm khởi công xây dựng căn cứ Ba Đình chép theo ''Từ điển bách khoa Việt Nam'' [http://dictionary.bachkhoatoanthu.gov.vn/default.aspx?param=1CAEaWQ9MjcyMzQmZ3JvdXBpZD0ma2luZD1leGFjdCZrZXl3b3JkPUJBKyVjNCU5MCVjMyU4Y05I&page=1].</ref>, căn cứ Ba Đình được khởi công xây dựng ở huyện [[Nga Sơn]] ([[Thanh Hoá]]), ông đem quân tới tham gia tích cực. Từ đây, các thủ lĩnh nghĩa quân, trong có có ông, đã dẫn quân đi tấn công thành tỉnh [[Thanh Hóa]] đêm 11 rạng ngày 12 [[tháng 3]] năm [[1886]].
Đầu năm [[1887]], quân [[thực dân Pháp|Pháp]] tấn công căn cứ Ba Đình. Sau khi căn cứ này thất thủ, Lê Khắc Tháo rút quân lên miền núi, nhưng dọc đường bị sốt nặng rồi mất. Khi đó ông mới 28 tuổi.
