Natri clorit là một chất oxi hoá mạnh và vì thế có thể cho rằng nó có thể gây ra một vài triệu chứng tương tự như [[natri clorat]]: [[chứng dư methemoglobin]], [[xuất huyết]], [[suy thận]]<ref>Goldfrank's Toxicologic Emergencies, McGraw-Hill Professional; 8th edition (ngày 28 tháng 3 năm 2006), ISBN 978-0071437639</ref>. Một liều 10-15 gam [[natri clorat]] có thể làm chết người.<ref>http://www.poisoncentre.be/article.php?id_article=39</ref>. [[Chứng dư methemoglobin]] đã được chứng minh ở chuột và mèo <ref>Clinical Toxicology of Commercial Products. Robert E. Gosselin, Roger P. Smith, Harold C. Hodge, Jeannet Braddock. Uitgever: Williams & Wilkins; 5 edition (September 1984) ISBN 978-0683036329</ref> và nghiên cứu mới đây của [[EMEA]] đã chỉ ra rằng những triệu chứng y khoa rất giống với triệu chứng gây ra bởi [[natri clorat]] ở chuột, chuột đồng, thỏ và [[Chlorocebus|khỉ xanh]] <ref>Sodium Chlorite - Summary Report of the Europena Agency for the Evaluation of Medicinal Products - Veterinary Medicines Evaluation Unit [http://www.emea.europa.eu/pdfs/vet/mrls/sodiumchlorite.pdf]</ref>
Mới chỉ có một trường hợp ngộ độc clorit được ghi nhận.<ref>Ngộ độc natri clorit cấp tính liên quan với chứng suy thận. Lin JL, Lim PS. Ren Fail. 1993;15(5):645-8. PMID 8290712
</ref>. Điều này cho thấy độc tính của natri clorit ngang bằng với [[natri clorat]]. Từ những phân tích với natri clorat, thậm chí chỉ với 1 lượng nhỏ khoảng 1 gam được dự đoán có thể gây [[buồn nôn]], [[nôn mửa]] và có thể cả xuất huyết đe doạ tính mạng bởi sự thiếu hụt [[Glucose-6-Phosphate Dehydrogenase]].
