{{Chính|Tồn tại sinh học của hợp chất hữu cơ fluor hóa}}
[[Tập tin:PFOS-3D-vdW.png|nhỏ|Acid perfluoroctansulfonic, một thành phần chính trong Scotchgard của [[3M]] đến năm 2000{{sfn|Schwarcz|2004|p=37}}]]
Các hợp chất hữu cơ của fluor thể hiện sự tồn tại lâu dài trong môi trường do độ bền của liên kết carbon–fluor. [[Acid perfluoroalkine]] (PFAA), những chất ít tan trong nước do các nhóm chức acid của chúng, được cho là [[chất ô nhiễm hữu cơ khó phân hủy]];<ref>{{Harvnb|Giesy|Kannan|2002}}.</ref> [[acid perfluoroctansulfonicperfluorooctansulfonic]] (PFOS) và [[acid perfluorooctanoic]] (PFOA) là những chất được nghiên cứu thường xuyên nhất.<ref name="PFOA">{{harvnb|Steenland|Fletcher|Savitz|2010}}.</ref><ref name="PFOA evidence">{{harvnb|Betts|2007}}.</ref><ref>{{Harvnb|EPA|2012}}.</ref> PFAA đã được tìm thấy ở lượng nhỏ trên toàn thế giới từ gấu Bắc Cực cho đến con người, còn PFOS và PFOA được cho là có trong sữa mẹ và máu của trẻ sơ sinh. Một bài báo năm 2013 cho thấy sự tương quan nhẹ giữa nồng độ PFAA trong nước ngầm và đất với hoạt động của con người; không có dấu hiệu rõ ràng cho thấy một chất hóa học chiếm ưu thế, và lượng PFOS lớn hơn có tương quan với lượng PFOA lớn hơn.<ref name="PFOA" /><ref name="PFOA evidence" /><ref>{{Harvnb|Zareitalabad|Siemens|Hamer|Amelung|2013}}.</ref> Trong cơ thể, PFAA liên kết với các protein như [[serum albumin]]; chúng có xu hướng tập trung trong gan và máu của người trước khi được thải ra ngoài qua thận. Thời gian ở lại trong cơ thể khác nhau rất nhiều ở các loài vật khác nhau, với chu kỳ bán rã là vài ngày ở động vật gặm nhấm và vài năm ở người.<ref name="PFOA" /><ref name="PFOA evidence" /><ref name="tox">{{harvnb|Lau và đồng nghiệp|2007}}.</ref> Hiện tượng quá liều PFOS và PFOA gây ung thư và tử vong ở động vật gặm nhấm sơ sinh nhưng các nghiên cứu trên người vẫn chưa xác định được ảnh hưởng cụ thể tại mức độ nhiễm độc như hiện tại.<ref name="PFOA" /><ref name="PFOA evidence" /><ref name="tox" />
