Protein ribosome 60S L3

RPL3
Cấu trúc được biết đến
PDB	Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB
Danh sách mã id PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0
Mã định danh
Danh pháp	RPL3, ASC-1, L3, TARBP-B, ribosomal protein L3
ID ngoài	OMIM: 604163 HomoloGene: 747 GeneCards: RPL3
Vị trí gen (Người)
NST	Nhiễm sắc thể 22 (người)
Kết thúc	39,320,389 bp
Bản thể gen
Chức năng phân tử	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • 5S rRNA binding; • RNA binding; • structural constituent of ribosome;
Thành phần tế bào	• ribosome; • focal adhesion; • nội bào; • extracellular exosome; • Hạch nhân; • nhân tế bào; • tế bào chất; • cytosolic large ribosomal subunit; • cytosol; • GO:0009327 protein-containing complex; • Xynap;
Quá trình sinh học	• cellular response to interleukin-4; • viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • rRNA processing; • ribosomal large subunit assembly; • sinh tổng hợp protein;
	Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
	6122
	n/a
	ENSG00000100316
	n/a
	P39023
	n/a
	NM_001033853; NM_000967
	n/a
	NP_000958; NP_001029025
	n/a
	Wikidata
Xem/Sửa Người

Protein ribosome 60S L3 là một protein mà ở người thì được mã hóa bởi gen RPL3.^[1]^[2]^[3]

Chức năng sửa

Ribosome, phức hợp mà xúc tác cho quá trình tổng hợp protein, bao gồm một tiểu đơn vị 40S nhỏ và một tiểu đơn vị 60S lớn. Các tiểu đơn vị này bao gồm bốn loại RNA và khoảng 80 protein riêng biệt về mặt cấu trúc. Gen RPL3 này mã hóa một protein ribosome là thành phần của tiểu đơn vị 60S. Protein thuộc họ L3P của các protein ribosome và nó nằm trong tế bào chất. Protein có thể liên kết với mRNA TAR HIV-1, và nó đã được gợi ý rằng protein đóng góp cho hoạt động hoạt hóa chéo qua trung gian là protein tat. Gen này được đồng phiên mã với một số gen RNA hạt nhân nhỏ, nằm ở một số vùng intron của gen này. Các biến thể cắt nối phiên mã khác nhau, mã hóa cho các đồng dạng khác nhau, đều đã được mô tả và phân lập. Như là điển hình cho các gen mã hóa protein ribosome, có nhiều gen giả của gen này được nhân lên và phát tán trong khắp bộ gen.^[3]

Chú thích sửa

^ Ou JH, Yen TS, Wang YF, Kam WK, Rutter WJ (tháng 1 năm 1988). “Cloning and characterization of a human ribosomal protein gene with enhanced expression in fetal and neoplastic cells”. Nucleic Acids Res. 15 (21): 8919–34. doi:10.1093/nar/15.21.8919. PMC 306413. PMID 2891103.
^ Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (tháng 5 năm 1998). “A Map of 75 Human Ribosomal Protein Genes”. Genome Research. 8 (5): 509–523. doi:10.1101/gr.8.5.509. PMID 9582194.
^ ^a ^b “Entrez Gene: RPL3 ribosomal protein L3”.
^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100316 - Ensembl, May 2017
^ “Human PubMed Reference:”.

Đọc thêm sửa

Wool IG, Chan YL, Glück A (1996). “Structure and evolution of mammalian ribosomal proteins”. Biochem. Cell Biol. 73 (11–12): 933–47. doi:10.1139/o95-101. PMID 8722009.
Adams MD, Dubnick M, Kerlavage AR, Moreno R, Kelley JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (1992). “Sequence identification of 2,375 human brain genes”. Nature. 355 (6361): 632–4. Bibcode:1992Natur.355..632A. doi:10.1038/355632a0. PMID 1538749.
Reddy TR, Suhasini M, Rappaport J, Looney DJ, Kraus G, Wong-Staal F (1995). “Molecular cloning and characterization of a TAR-binding nuclear factor from T cells”. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 11 (6): 663–9. doi:10.1089/aid.1995.11.663. PMID 7576925.
Matoba R, Okubo K, Hori N, Fukushima A, Matsubara K (1994). “The addition of 5'-coding information to a 3'-directed cDNA library improves analysis of gene expression”. Gene. 146 (2): 199–207. doi:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID 8076819.
Van Raay TJ, Connors TD, Klinger KW, Landes GM, Burn TC (1997). “A novel ribosomal protein L3-like gene (RPL3L) maps to the autosomal dominant polycystic kidney disease gene region”. Genomics. 37 (2): 172–6. doi:10.1006/geno.1996.0538. PMID 8921388.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN, Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). “The DNA sequence of human chromosome 22”. Nature. 402 (6761): 489–95. Bibcode:1999Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
Duga S, Asselta R, Malcovati M, Tenchini ML, Ronchi S, Simonic T (2000). “The intron-containing L3 ribosomal protein gene (RPL3): sequence analysis and identification of U43 and of two novel intronic small nucleolar RNAs”. Biochim. Biophys. Acta. 1490 (3): 225–36. doi:10.1016/S0167-4781(99)00237-7. PMID 10684968.
Uechi T, Tanaka T, Kenmochi N (2001). “A complete map of the human ribosomal protein genes: assignment of 80 genes to the cytogenetic map and implications for human disorders”. Genomics. 72 (3): 223–30. doi:10.1006/geno.2000.6470. PMID 11401437.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (2002). “Directed proteomic analysis of the human nucleolus”. Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016/S0960-9822(01)00650-9. PMID 11790298.
Odintsova TI, Müller EC, Ivanov AV, Egorov TA, Bienert R, Vladimirov SN, Kostka S, Otto A, Wittmann-Liebold B, Karpova GG (2004). “Characterization and analysis of posttranslational modifications of the human large cytoplasmic ribosomal subunit proteins by mass spectrometry and Edman sequencing”. J. Protein Chem. 22 (3): 249–58. doi:10.1023/A:1025068419698. PMID 12962325.
Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M, Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). “A physical and functional map of the human TNF-alpha/NF-kappa B signal transduction pathway”. Nat. Cell Biol. 6 (2): 97–105. doi:10.1038/ncb1086. PMID 14743216.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). “A genome annotation-driven approach to cloning the human ORFeome”. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186/gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). “Immunoaffinity profiling of tyrosine phosphorylation in cancer cells”. Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038/nbt1046. PMID 15592455.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). “Nucleolar proteome dynamics”. Nature. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Natur.433...77A. doi:10.1038/nature03207. PMID 15635413.

[pmid2891103-1] Ou JH, Yen TS, Wang YF, Kam WK, Rutter WJ (tháng 1 năm 1988). “Cloning and characterization of a human ribosomal protein gene with enhanced expression in fetal and neoplastic cells”. Nucleic Acids Res. 15 (21): 8919–34. doi:10.1093/nar/15.21.8919. PMC 306413. PMID 2891103.

[pmid9582194-2] Kenmochi N, Kawaguchi T, Rozen S, Davis E, Goodman N, Hudson TJ, Tanaka T, Page DC (tháng 5 năm 1998). “A Map of 75 Human Ribosomal Protein Genes”. Genome Research. 8 (5): 509–523. doi:10.1101/gr.8.5.509. PMID 9582194.

[entrez-3] “Entrez Gene: RPL3 ribosomal protein L3”.

[refGRCh38Ensembl-4] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100316 - Ensembl, May 2017

[5] “Human PubMed Reference:”.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]