Chức danh tiền thân của Phủ doãn, được gọi là Kinh thành bìnhBình bạcBạc ty{{efn|Bình Bạc ty là đơn vị hành chính tư pháp được đặt ra từ dưới triều vua Trần Thái Tông, nhằm quản lý an ninh và công pháp khu vực kinh thành Thăng Long.}}, được thành lập vào khoảng niên hiệu Kiến Trung (1225–1232) triều vua [[Trần Thái Tông]]. Dưới các đời vua tiếp nối, chức danh này lần lượt đổi tên thành Kinh sư Đại an phủ sứ (dưới triều vua [[Trần Thánh Tông]]), Kinh sư Đại doãn (triều vua [[Trần Hiến Tông]]), Trung Đô doãn (triều vua [[Trần Thuận Tông]]).<ref name="Đỗ Minh Điền p.34"/>
Thời [[nhà Lê]] khi kinh thành [[Thăng Long]] mang tên "Đông Kinh" thì phủ doãn là quan đứng đầu [[phủ Phụng Thiên]] gồm hai [[huyện Vĩnh Xương]] và [[huyện Quảng Đức]].
