ATBF1

ZFHX3
Cấu trúc được biết đến
PDB	Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB
Danh sách mã id PDB
	2DA1, 2DA2, 2DA3
Mã định danh
Danh pháp	ZFHX3, ATBF1, ATBT, ZNF927, zinc finger homeobox 3
ID ngoài	OMIM: 104155 HomoloGene: 21366 GeneCards: ZFHX3
Vị trí gen (Người)
NST	Nhiễm sắc thể 16 (người)
Kết thúc	73,891,871 bp
Mẫu hình biểu hiện RNA
	Thêm nguồn tham khảo về sự biểu hiện
Bản thể gen
Chức năng phân tử	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • metal ion binding; • core promoter sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • enzyme binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Thành phần tế bào	• tế bào chất; • nuclear body; • transcription regulator complex; • nhân tế bào; • Chất nhân;
Quá trình sinh học	• negative regulation of myoblast differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of locomotor rhythm; • muscle organ development; • transcription by RNA polymerase II; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of myoblast differentiation; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • response to transforming growth factor beta; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • brain development; • regulation of neuron differentiation; • positive regulation of cell adhesion; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
	463
	n/a
	ENSG00000140836
	n/a
	Q15911
	n/a
	NM_001164766; NM_006885
	n/a
	NP_001158238; NP_008816
	n/a
	Wikidata
Xem/Sửa Người

Zinc finger homeobox protein 3 (ATBF1) là một protein ở người được mã hóa bởi gen ZFHX3 gene.^[3]^[4]^[5]

Tham khảo sửa

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140836 - Ensembl, May 2017
^ “Human PubMed Reference:”.
^ Morinaga T, Yasuda H, Hashimoto T, Higashio K, Tamaoki T (tháng 12 năm 1991). “A human alpha-fetoprotein enhancer-binding protein, ATBF1, contains four homeodomains and seventeen zinc fingers”. Mol Cell Biol. 11 (12): 6041–9. PMC 361769. PMID 1719379.
^ Miura Y, Tam T, Ido A, Morinaga T, Miki T, Hashimoto T, Tamaoki T (tháng 12 năm 1995). “Cloning and characterization of an ATBF1 isoform that expresses in a neuronal differentiation-dependent manner”. J Biol Chem. 270 (45): 26840–8. doi:10.1074/jbc.270.45.26840. PMID 7592926.
^ “Entrez Gene: ATBF1 AT-binding transcription factor 1”.

Đọc thêm sửa

Yamada K, Miura Y, Scheidl T, và đồng nghiệp (1996). “Assignment of the human ATBF1 transcription factor gene to chromosome 16q22.3-q23.1”. Genomics. 29 (2): 552–3. doi:10.1006/geno.1995.9967. PMID 8666409.
Bedford MT, Chan DC, Leder P (1997). “FBP WW domains and the Abl SH3 domain bind to a specific class of proline-rich ligands”. EMBO J. 16 (9): 2376–83. doi:10.1093/emboj/16.9.2376. PMC 1169838. PMID 9171351.
Kaspar P, Dvoráková M, Králová J, và đồng nghiệp (1999). “Myb-interacting protein, ATBF1, represses transcriptional activity of Myb oncoprotein”. J. Biol. Chem. 274 (20): 14422–8. doi:10.1074/jbc.274.20.14422. PMID 10318867.
Loftus BJ, Kim UJ, Sneddon VP, và đồng nghiệp (1999). “Genome duplications and other features in 12 Mb of DNA sequence from human chromosome 16p and 16q”. Genomics. 60 (3): 295–308. doi:10.1006/geno.1999.5927. PMID 10493829.
Kaushik N, Malaspina A, de Belleroche J (2000). “Characterization of trinucleotide- and tandem repeat-containing transcripts obtained from human spinal cord cDNA library by high-density filter hybridization”. DNA Cell Biol. 19 (5): 265–73. doi:10.1089/10445490050021177. PMID 10855793.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, và đồng nghiệp (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Iida M, Imura J, Furuichi T, và đồng nghiệp (2004). “Alteration of the AT motif binding factor-1 expression in alpha-fetoprotein producing gastric cancer: is it an event for differentiation and proliferation of the tumors?”. Oncol. Rep. 11 (1): 3–7. doi:10.3892/or.11.1.3. PMID 14654895.
Nojiri S, Joh T, Miura Y, và đồng nghiệp (2004). “ATBF1 enhances the suppression of STAT3 signaling by interaction with PIAS3”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 314 (1): 97–103. doi:10.1016/j.bbrc.2003.12.054. PMID 14715251.
Martin J, Han C, Gordon LA, và đồng nghiệp (2005). “The sequence and analysis of duplication-rich human chromosome 16”. Nature. 432 (7020): 988–94. doi:10.1038/nature03187. PMID 15616553.
Zhang Z, Yamashita H, Toyama T, và đồng nghiệp (2005). “ATBF1-a messenger RNA expression is correlated with better prognosis in breast cancer”. Clin. Cancer Res. 11 (1): 193–8. PMID 15671546.
Sun X, Frierson HF, Chen C, và đồng nghiệp (2005). “Frequent somatic mutations of the transcription factor ATBF1 in human prostate cancer”. Nat. Genet. 37 (4): 407–12. doi:10.1038/ng1528. PMID 15750593.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, và đồng nghiệp (2005). “Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network”. Nature. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514.
Xu J, Sauvageot J, Ewing CM, và đồng nghiệp (2006). “Germline ATBF1 mutations and prostate cancer risk”. Prostate. 66 (10): 1082–5. doi:10.1002/pros.20430. PMID 16637072.
Sun X, Zhou Y, Otto KB, và đồng nghiệp (2007). “Infrequent mutation of ATBF1 in human breast cancer”. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 133 (2): 103–5. doi:10.1007/s00432-006-0148-y. PMID 16932943.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, và đồng nghiệp (2006). “Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks”. Cell. 127 (3): 635–48. doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Mori Y, Kataoka H, Miura Y, và đồng nghiệp (2007). “Subcellular localization of ATBF1 regulates MUC5AC transcription in gastric cancer”. Int. J. Cancer. 121 (2): 241–7. doi:10.1002/ijc.22654. PMID 17330845.
Cho YG, Song JH, Kim CJ, và đồng nghiệp (2007). “Genetic alterations of the ATBF1 gene in gastric cancer”. Clin. Cancer Res. 13 (15 Pt 1): 4355–9. doi:10.1158/1078-0432.CCR-07-0619. PMID 17671116.

Liên kết ngoài sửa

MeSH ATBF1+protein,+human
Vị trí bộ gen ZFHX3 ở người và thông tin chi tiết về gen ZFHX3 có sẵn trên UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000140836 - Ensembl, May 2017

[2] “Human PubMed Reference:”.

[pmid1719379-3] Morinaga T, Yasuda H, Hashimoto T, Higashio K, Tamaoki T (tháng 12 năm 1991). “A human alpha-fetoprotein enhancer-binding protein, ATBF1, contains four homeodomains and seventeen zinc fingers”. Mol Cell Biol. 11 (12): 6041–9. PMC 361769. PMID 1719379.

[pmid7592926-4] Miura Y, Tam T, Ido A, Morinaga T, Miki T, Hashimoto T, Tamaoki T (tháng 12 năm 1995). “Cloning and characterization of an ATBF1 isoform that expresses in a neuronal differentiation-dependent manner”. J Biol Chem. 270 (45): 26840–8. doi:10.1074/jbc.270.45.26840. PMID 7592926.

[entrez-5] “Entrez Gene: ATBF1 AT-binding transcription factor 1”.

[3]

[4]

[5]

[1]

[2]