COPA

COPA
Cấu trúc được biết đến
PDB	Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB
Danh sách mã id PDB
	5A1U, 5A1V, 5A1W, 5A1X, 5A1Y
Mã định danh
Danh pháp	COPA, HEP-COP, AILJK, coatomer protein complex subunit alpha, alpha-COP, COPI coat complex subunit alpha
ID ngoài	OMIM: 601924 HomoloGene: 3218 GeneCards: COPA
Mẫu hình biểu hiện RNA
	; ;
	Thêm nguồn tham khảo về sự biểu hiện
Bản thể gen
Chức năng phân tử	• hormone activity; • structural molecule activity;
Thành phần tế bào	• tế bào chất; • cytosol; • bộ máy Golgi; • membrane; • Golgi membrane; • COPI-coated vesicle membrane; • transport vesicle; • extracellular region; • membrane coat; • COPI vesicle coat; • extracellular exosome; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • endoplasmic reticulum membrane; • extracellular space;
Quá trình sinh học	• retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum; • pancreatic juice secretion; • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; • protein transport; • intracellular protein transport; • intra-Golgi vesicle-mediated transport; • vesicle-mediated transport; • GO:0015915 transport; • regulation of signaling receptor activity; • GO:0072468 signal transduction;
	Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
	1314
	n/a
	n/a
	n/a
	P53621
	n/a
	NM_004371; NM_001098398
	n/a
	NP_001091868; NP_004362
	n/a
	Wikidata
Xem/Sửa Người

Tiểu đơn vị alpha của coatomer (tiếng Anh: Coatomer subunit alpha) là protein ở người được mã hóa bởi gen COPA.^[2]^[3]

Chức năng sửa

Trong tế bào nhân thực, sự vận chuyển protein giữa lưới nội chất và bộ máy Golgi được trung gian một phần bởi những protein vỏ túi không clathrin (coat protein, COP). Bảy protein vỏ đã được xác định, và chúng đại diện cho các tiểu đơn vị thuộc một phức hệ gọi là coatomer. Bao gồm những tiểu đơn vị alpha-COP, beta-COP, beta-prime-COP, gamma-COP, delta-COP, epsilon-COP và zeta-COP. Alpha-COP do COPA mã hóa sở hữu mật độ tương đồng trình tự cao với RET1P, tiểu đơn vị alpha của phức hệ coatomer ở nấm men.^[4] Đồng thời, 25 amino acid đầu N của alpha-COP mã hóa cho xenin, peptide có hoạt tính sinh học, giúp kích thích tụy ngoại tiết và hoạt động như một hormone ruột kết-dạ dày. Sự cắt nối luân phiên dẫn đến kết quả mã hóa những isoform khác biệt ở nhiều dạng ghép nối.^[3]

Tương tác sửa

COPA (gen) có khả năng tương tác với COPE^[5]^[6]^[7] và COPB1.^[8]

Tham khảo sửa

^ “Human PubMed Reference:”.
^ Chow VT, Quek HH (tháng 7 năm 1996). “HEP-COP, a novel human gene whose product is highly homologous to the alpha-subunit of the yeast coatomer protein complex”. Gene. 169 (2): 223–7. doi:10.1016/0378-1119(95)00738-5. PMID 8647451.
^ ^a ^b “Entrez Gene: COPA coatomer protein complex, subunit alpha”.
^ Gerich B, Orci L, Tschochner H, Lottspeich F, Ravazzola M, Amherdt M, Wieland F, Harter C (tháng 4 năm 1995). “Non-clathrin-coat protein alpha is a conserved subunit of coatomer and in Saccharomyces cerevisiae is essential for growth”. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa KỳA. 92 (8): 3229–33. doi:10.1073/pnas.92.8.3229. PMC 42139. PMID 7724544.
^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (tháng 9 năm 2005). “A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome”. Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
^ Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (tháng 8 năm 2000). “COP I domains required for coatomer integrity, and novel interactions with ARF and ARF-GAP”. EMBO J. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093/emboj/19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.
^ Faulstich D, Auerbach S, Orci L, Ravazzola M, Wegchingel S, Lottspeich F, Stenbeck G, Harter C, Wieland FT, Tschochner H (tháng 10 năm 1996). “Architecture of coatomer: molecular characterization of delta-COP and protein interactions within the complex”. J. Cell Biol. 135 (1): 53–61. doi:10.1083/jcb.135.1.53. PMC 2121028. PMID 8858162.
^ Lowe M, Kreis TE (tháng 11 năm 1996). “In vivo assembly of coatomer, the COP-I coat precursor”. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074/jbc.271.48.30725. PMID 8940050.

Liên kết ngoài sửa

Vị trí bộ gen COPA ở người và thông tin chi tiết về gen COPA có sẵn trên UCSC Genome Browser.

Đọc thêm sửa

Feurle GE (1998). “Xenin--a review”. Peptides. 19 (3): 609–15. doi:10.1016/S0196-9781(97)00378-1. PMID 9533652.
Feurle GE, Hamscher G, Kusiek R, và đồng nghiệp (1992). “Identification of xenin, a xenopsin-related peptide, in the human gastric mucosa and its effect on exocrine pancreatic secretion”. J. Biol. Chem. 267 (31): 22305–9. PMID 1429581.
Orcl L, Palmer DJ, Amherdt M, Rothman JE (1993). “Coated vesicle assembly in the Golgi requires only coatomer and ARF proteins from the cytosol”. Nature. 364 (6439): 732–4. doi:10.1038/364732a0. PMID 8355790.
Lowe M, Kreis TE (1996). “In vitro assembly and disassembly of coatomer”. J. Biol. Chem. 270 (52): 31364–71. doi:10.1074/jbc.270.52.31364. PMID 8537409.
Fiedler K, Veit M, Stamnes MA, Rothman JE (1996). “Bimodal interaction of coatomer with the p24 family of putative cargo receptors”. Science. 273 (5280): 1396–9. doi:10.1126/science.273.5280.1396. PMID 8703076.
Faulstich D, Auerbach S, Orci L, và đồng nghiệp (1996). “Architecture of coatomer: molecular characterization of delta-COP and protein interactions within the complex”. J. Cell Biol. 135 (1): 53–61. doi:10.1083/jcb.135.1.53. PMC 2121028. PMID 8858162.
Lowe M, Kreis TE (1997). “In vivo assembly of coatomer, the COP-I coat precursor”. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074/jbc.271.48.30725. PMID 8940050.
Quek HH, Chow VT (1997). “Molecular and cellular studies of the human homolog of the 160-kD alpha-subunit of the coatomer protein complex”. DNA Cell Biol. 16 (3): 275–80. doi:10.1089/dna.1997.16.275. PMID 9115636.
Quek HH, Chow VT (1997). “Genomic organization and mapping of the human HEP-COP gene (COPA) to 1q”. Cytogenet. Cell Genet. 76 (3–4): 139–43. doi:10.1159/000134532. PMID 9186507.
Hansen K, Rönnstrand L, Rorsman C, và đồng nghiệp (1997). “Association of coatomer proteins with the beta-receptor for platelet-derived growth factor”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235 (3): 455–60. doi:10.1006/bbrc.1997.6821. PMID 9207175.
Chow VT, Quek HH (1997). “Alpha coat protein COPA (HEP-COP): presence of an Alu repeat in cDNA and identity of the amino terminus to xenin”. Ann. Hum. Genet. 61 (Pt 4): 369–73. doi:10.1046/j.1469-1809.1997.6140369.x. PMID 9365789.
Pavel J, Harter C, Wieland FT (1998). “Reversible dissociation of coatomer: Functional characterization of a β/δ-coat protein subcomplex”. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa KỳA. 95 (5): 2140–5. doi:10.1073/pnas.95.5.2140. PMC 19276. PMID 9482852.
Harter C, Wieland FT (1998). “A single binding site for dilysine retrieval motifs and p23 within the γ subunit of coatomer”. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa KỳA. 95 (20): 11649–54. doi:10.1073/pnas.95.20.11649. PMC 21695. PMID 9751720.
Zhang T, Hong W (2001). “Ykt6 forms a SNARE complex with syntaxin 5, GS28, and Bet1 and participates in a late stage in endoplasmic reticulum-Golgi transport”. J. Biol. Chem. 276 (29): 27480–7. doi:10.1074/jbc.M102786200. PMID 11323436.
Yang JS, Lee SY, Gao M, và đồng nghiệp (2002). “ARFGAP1 promotes the formation of COPI vesicles, suggesting function as a component of the coat”. J. Cell Biol. 159 (1): 69–78. doi:10.1083/jcb.200206015. PMC 2173491. PMID 12379802.
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (2003). “GS15 Forms a SNARE Complex with Syntaxin 5, GS28, and Ykt6 and Is Implicated in Traffic in the Early Cisternae of the Golgi Apparatus”. Mol. Biol. Cell. 13 (10): 3493–507. doi:10.1091/mbc.E02-01-0004. PMC 129961. PMID 12388752.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, và đồng nghiệp (2003). “Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa KỳA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Wong N, Chan A, Lee SW, và đồng nghiệp (2003). “Positional mapping for amplified DNA sequences on 1q21-q22 in hepatocellular carcinoma indicates candidate genes over-expression”. J. Hepatol. 38 (3): 298–306. doi:10.1016/S0168-8278(02)00412-9. PMID 12586295.

Bài viết về một gen trên nhiễm sắc thể 1 ở người này vẫn còn sơ khai. Bạn có thể giúp Wikipedia mở rộng nội dung để bài được hoàn chỉnh hơn.

[1] “Human PubMed Reference:”.

[pmid8647451-2] Chow VT, Quek HH (tháng 7 năm 1996). “HEP-COP, a novel human gene whose product is highly homologous to the alpha-subunit of the yeast coatomer protein complex”. Gene. 169 (2): 223–7. doi:10.1016/0378-1119(95)00738-5. PMID 8647451.

[entrez-3] “Entrez Gene: COPA coatomer protein complex, subunit alpha”.

[pmid7724544-4] Gerich B, Orci L, Tschochner H, Lottspeich F, Ravazzola M, Amherdt M, Wieland F, Harter C (tháng 4 năm 1995). “Non-clathrin-coat protein alpha is a conserved subunit of coatomer and in Saccharomyces cerevisiae is essential for growth”. Proc. Natl. Acad. Sci. Hoa KỳA. 92 (8): 3229–33. doi:10.1073/pnas.92.8.3229. PMC 42139. PMID 7724544.

[pmid16169070-5] Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (tháng 9 năm 2005). “A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome”. Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.

[pmid10921873-6] Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (tháng 8 năm 2000). “COP I domains required for coatomer integrity, and novel interactions with ARF and ARF-GAP”. EMBO J. 19 (15): 3905–17. doi:10.1093/emboj/19.15.3905. PMC 306616. PMID 10921873.

[pmid8858162-7] Faulstich D, Auerbach S, Orci L, Ravazzola M, Wegchingel S, Lottspeich F, Stenbeck G, Harter C, Wieland FT, Tschochner H (tháng 10 năm 1996). “Architecture of coatomer: molecular characterization of delta-COP and protein interactions within the complex”. J. Cell Biol. 135 (1): 53–61. doi:10.1083/jcb.135.1.53. PMC 2121028. PMID 8858162.

[pmid8940050-8] Lowe M, Kreis TE (tháng 11 năm 1996). “In vivo assembly of coatomer, the COP-I coat precursor”. J. Biol. Chem. 271 (48): 30725–30. doi:10.1074/jbc.271.48.30725. PMID 8940050.

[2]

[3]

[1]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]