Protein ribosome 60S L5

RPL5
Cấu trúc được biết đến
PDB	Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB
Danh sách mã id PDB
	4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4UJD, 4D67, 4D5Y, 4UJE, 4UJC
Mã định danh
Danh pháp	RPL5, DBA6, L5, PPP1R135, MSTP030, Ribosomal protein L5, uL18
ID ngoài	OMIM: 603634 HomoloGene: 110649 GeneCards: RPL5
Mẫu hình biểu hiện RNA
	; ; ; ;
	Thêm nguồn tham khảo về sự biểu hiện
Bản thể gen
Chức năng phân tử	• rRNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • structural constituent of ribosome; • mRNA 3'-UTR binding; • 5S rRNA binding; • ubiquitin protein ligase binding; • mRNA 5'-UTR binding; • GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity;
Thành phần tế bào	• tế bào chất; • cytosol; • ribosome; • membrane; • focal adhesion; • nội bào; • Hạch nhân; • cytosolic large ribosomal subunit; • extracellular exosome; • nhân tế bào; • Chất nhân; • Mạng lưới nội chất; • GO:0009327 protein-containing complex; • Xynap; • ribonucleoprotein complex;
Quá trình sinh học	• viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • ribosomal large subunit biogenesis; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • rRNA processing; • ribosomal large subunit assembly; • sinh tổng hợp protein; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • positive regulation of translation; • protein stabilization; • GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity; • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; • negative regulation of protein neddylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
	6125
	n/a
	ENSG00000122406
	n/a
	P46777; Q5T7N0
	n/a
	NM_000969
	n/a
	NP_000960
	n/a
	Wikidata
Xem/Sửa Người

Protein ribosome 60S L5 là một protein ở người thì được mã hóa bởi gen RPL5.^[2]^[3]

Chức năng sửa

Ribosome, phức hợp mà xúc tác cho quá trình tổng hợp protein, bao gồm một tiểu đơn vị 40S nhỏ và một tiểu đơn vị 60S lớn. Các tiểu đơn vị này bao gồm bốn loại RNA và khoảng 80 protein riêng biệt về mặt cấu trúc. Gen này mã hóa một protein ribosome này là một thành phần của tiểu đơn vị 60S. Protein thuộc họ L18P trong các protein ribosome. Protein này nằm trong tế bào chất. Protein liên kết với rRNA 5S để tạo thành một phức hợp ổn định được gọi là hạt ribonucleoprotein 5S (RNP- ribonucleoprotein particle). Phức hệ này cần thiết cho việc vận chuyển rRNA 5S không gắn ribosome đến nhân con để lắp ráp thành ribosome. Protein tương tác riêng với tiểu đơn vị beta của casein kinase 2.

Ý nghĩa y khoa sửa

Những biểu hiện bất thường của gen này trong ung thư đại trực tràng so với mô bình thường liền kề đã được quan sát thấy, mặc dù mối tương quan giữa mức độ biểu hiện và mức độ nghiêm trọng của bệnh thì còn chưa rõ ràng. Gen này được đồng phiên mã với gen RNA U21 hạt nhân nhỏ, nằm ở intron thứ năm của nó. Như là điển hình cho các gen mã hóa protein ribosome, có nhiều gen giả của gen này được nhân lên và phát tán khắp hệ gen.^[4]

Tương tác sửa

Protein ribosome 60S L5 được cho là có thể tương tác với:

CSNK2B,^[5]^[6]^[7]^[8]
EIF5A,^[9]
Mdm2,^[10]^[11]^[12] và
PDCD4.^[13]

Chú thích sửa

^ “Human PubMed Reference:”.
^ Qu LH, Nicoloso M, Michot B, Azum MC, Caizergues-Ferrer M, Renalier MH, Bachellerie JP (tháng 11 năm 1994). “U21, a novel small nucleolar RNA with a 13 nt. complementarity to 28S rRNA, is encoded in an intron of ribosomal protein L5 gene in chicken and mammals”. Nucleic Acids Res. 22 (20): 4073–81. doi:10.1093/nar/22.20.4073. PMC 331892. PMID 7937132.
^ Frigerio JM, Dagorn JC, Iovanna JL (tháng 7 năm 1995). “Cloning, sequencing and expression of the L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 and S29 human ribosomal protein mRNAs”. Biochim Biophys Acta. 1262 (1): 64–8. doi:10.1016/0167-4781(95)00045-i. PMID 7772601.
^ “Entrez Gene: RPL5 ribosomal protein L5”.
^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (tháng 1 năm 2004). “Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region”. Genomics. 83 (1): 153–67. doi:10.1016/s0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.
^ Boldyreff B, Issinger OG (tháng 2 năm 1997). “A-Raf kinase is a new interacting partner of protein kinase CK2 beta subunit”. FEBS Lett. 403 (2): 197–9. doi:10.1016/s0014-5793(97)00010-0. PMID 9042965.
^ Kim JM, Cha JY, Marshak DR, Bae YS (tháng 9 năm 1996). “Interaction of the beta subunit of casein kinase II with the ribosomal protein L5”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226 (1): 180–6. doi:10.1006/bbrc.1996.1330. PMID 8806611.
^ Ahn BH, Kim TH, Bae YS (tháng 10 năm 2001). “Mapping of the interaction domain of the protein kinase CKII beta subunit with target proteins”. Mol. Cells. 12 (2): 158–63. PMID 11710515.
^ Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (tháng 2 năm 1998). “Interaction of the HIV-1 rev cofactor eukaryotic initiation factor 5A with ribosomal protein L5”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (4): 1607–12. doi:10.1073/pnas.95.4.1607. PMC 19115. PMID 9465063.
^ Zhang Y, Wolf GW, Bhat K, Jin A, Allio T, Burkhart WA, Xiong Y (tháng 12 năm 2003). “Ribosomal protein L11 negatively regulates oncoprotein MDM2 and mediates a p53-dependent ribosomal-stress checkpoint pathway”. Mol. Cell. Biol. 23 (23): 8902–12. doi:10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003. PMC 262682. PMID 14612427.
^ Marechal V, Elenbaas B, Piette J, Nicolas JC, Levine AJ (tháng 11 năm 1994). “The ribosomal L5 protein is associated with mdm-2 and mdm-2-p53 complexes”. Mol. Cell. Biol. 14 (11): 7414–20. doi:10.1128/mcb.14.11.7414. PMC 359276. PMID 7935455.
^ Dai MS, Sun XX, Lu H (tháng 7 năm 2008). “Aberrant expression of nucleostemin activates p53 and induces cell cycle arrest via inhibition of MDM2”. Mol. Cell. Biol. 28 (13): 4365–76. doi:10.1128/MCB.01662-07. PMC 2447154. PMID 18426907.
^ Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (tháng 4 năm 2002). “Up-regulation of PDCD4 in senescent human diploid fibroblasts”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 617–21. doi:10.1016/S0006-291X(02)00264-4. PMID 12054647.

[1] “Human PubMed Reference:”.

[pmid7937132-2] Qu LH, Nicoloso M, Michot B, Azum MC, Caizergues-Ferrer M, Renalier MH, Bachellerie JP (tháng 11 năm 1994). “U21, a novel small nucleolar RNA with a 13 nt. complementarity to 28S rRNA, is encoded in an intron of ribosomal protein L5 gene in chicken and mammals”. Nucleic Acids Res. 22 (20): 4073–81. doi:10.1093/nar/22.20.4073. PMC 331892. PMID 7937132.

[pmid7772601-3] Frigerio JM, Dagorn JC, Iovanna JL (tháng 7 năm 1995). “Cloning, sequencing and expression of the L5, L21, L27a, L28, S5, S9, S10 and S29 human ribosomal protein mRNAs”. Biochim Biophys Acta. 1262 (1): 64–8. doi:10.1016/0167-4781(95)00045-i. PMID 7772601.

[entrez-4] “Entrez Gene: RPL5 ribosomal protein L5”.

[pmid14667819-5] Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (tháng 1 năm 2004). “Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region”. Genomics. 83 (1): 153–67. doi:10.1016/s0888-7543(03)00235-0. PMID 14667819.

[pmid9042965-6] Boldyreff B, Issinger OG (tháng 2 năm 1997). “A-Raf kinase is a new interacting partner of protein kinase CK2 beta subunit”. FEBS Lett. 403 (2): 197–9. doi:10.1016/s0014-5793(97)00010-0. PMID 9042965.

[pmid8806611-7] Kim JM, Cha JY, Marshak DR, Bae YS (tháng 9 năm 1996). “Interaction of the beta subunit of casein kinase II with the ribosomal protein L5”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 226 (1): 180–6. doi:10.1006/bbrc.1996.1330. PMID 8806611.

[pmid11710515-8] Ahn BH, Kim TH, Bae YS (tháng 10 năm 2001). “Mapping of the interaction domain of the protein kinase CKII beta subunit with target proteins”. Mol. Cells. 12 (2): 158–63. PMID 11710515.

[pmid9465063-9] Schatz O, Oft M, Dascher C, Schebesta M, Rosorius O, Jaksche H, Dobrovnik M, Bevec D, Hauber J (tháng 2 năm 1998). “Interaction of the HIV-1 rev cofactor eukaryotic initiation factor 5A with ribosomal protein L5”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (4): 1607–12. doi:10.1073/pnas.95.4.1607. PMC 19115. PMID 9465063.

[pmid14612427-10] Zhang Y, Wolf GW, Bhat K, Jin A, Allio T, Burkhart WA, Xiong Y (tháng 12 năm 2003). “Ribosomal protein L11 negatively regulates oncoprotein MDM2 and mediates a p53-dependent ribosomal-stress checkpoint pathway”. Mol. Cell. Biol. 23 (23): 8902–12. doi:10.1128/mcb.23.23.8902-8912.2003. PMC 262682. PMID 14612427.

[pmid7935455-11] Marechal V, Elenbaas B, Piette J, Nicolas JC, Levine AJ (tháng 11 năm 1994). “The ribosomal L5 protein is associated with mdm-2 and mdm-2-p53 complexes”. Mol. Cell. Biol. 14 (11): 7414–20. doi:10.1128/mcb.14.11.7414. PMC 359276. PMID 7935455.

[pmid18426907-12] Dai MS, Sun XX, Lu H (tháng 7 năm 2008). “Aberrant expression of nucleostemin activates p53 and induces cell cycle arrest via inhibition of MDM2”. Mol. Cell. Biol. 28 (13): 4365–76. doi:10.1128/MCB.01662-07. PMC 2447154. PMID 18426907.

[pmid12054647-13] Kang MJ, Ahn HS, Lee JY, Matsuhashi S, Park WY (tháng 4 năm 2002). “Up-regulation of PDCD4 in senescent human diploid fibroblasts”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293 (1): 617–21. doi:10.1016/S0006-291X(02)00264-4. PMID 12054647.

[2]

[3]

[1]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]