Wikipedia

Rc-o319

Rc-o319 là một chủng virus corona liên quan đến hội chứng hô hấp cấp tính nặng có nguồn gốc từ dơi được thu thập ở dơi móng ngựa Nhỏ Nhật Bản (Rhinolophus cornutus) ở Iwate, Nhật Bản.[1] Chủng này có mã gen tương đồng 81% với SARS-CoV-2 và là nhánh chủng sớm nhất của virus corona liên quan đến SARS-CoV-2.

Rc-o319
Phân loại virus e
(kph): Virus
Realm: Riboviria
Ngành: incertae sedis
Bộ: Nidovirales
Họ: Coronaviridae
Chi: Betacoronavirus
Phân chi: Sarbecovirus
Loài:
Virus corona liên quan đến hội chứng hô hấp cấp tính nặng
Strain:
Rc-o319

panCây phát sinh loài dựa trên trình tự toàn bộ bộ gen của SARS-CoV-2 và các virus corona liên quan:[2][3][4]

Virus corona liên quan đến SARS‑CoV‑2
 

Rc-o319, 81% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus cornutus, Iwate, Nhật Bản[1]

 
 
 
 

SL-ZXC21, 88% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, Chu Sơn, Chiết Giang[5]

 
 

SL-ZC45, 88% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, Chu Sơn, Chiết Giang[5]

 
 
 
 

SARSr-COV-GX tê tê, 89% tương đồng với SARS-COV-2, Manis javanica, từ Đông Nam Á[6]

 
 
 

SARSr-COV-GD tê tê, 91% tương đồng với SARS-COV-2, Manis javanica, từ Đông Nam Á[7]

 
 
 
 

RshSTT182, 92.6% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, Steung Treng, Campuchia[4]

 
 

RshSTT200, 92.6% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus shameli, Steung Treng, Campuchia[4]

 
 
 
 

RacCS203, 91.5% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus acuminatus, Chachoengsao, Thái Lan[3]

 
 

RmYN02, 93.3% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus malayanus Mãnh Lạp, Vân Nam[8]

 
 
 

RpYN06, 94.4% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus pusillus, Châu tự trị dân tộc Thái Tây Song Bản Nạp, Vân Nam[2]

 
 
 

RaTG13, 96.1% tương đồng với SARS-COV-2, Rhinolophus affinis, Huyện tự trị dân tộc Cáp Nê Mặc Giang, Vân Nam

 
 

SARS-CoV-2

 
 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-1, 79% tương đồng với SARS-COV-2

 

Tham khảo sửa

  1. ^ a b Murakami S, Kitamura T, Suzuki J, Sato R, Aoi T, Fujii M, và đồng nghiệp (tháng 12 năm 2020). “Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan”. Emerging Infectious Diseases. 26 (12): 3025–3029. doi:10.3201/eid2612.203386. PMC 7706965. PMID 33219796.
  2. ^ a b Zhou H, Ji J, Chen X, Bi Y, Li J, Wang Q, và đồng nghiệp (tháng 6 năm 2021). “Identification of novel bat coronaviruses sheds light on the evolutionary origins of SARS-CoV-2 and related viruses”. Cell: S0092867421007091. doi:10.1016/j.cell.2021.06.008. PMID 34147139.
  3. ^ a b Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, và đồng nghiệp (tháng 2 năm 2021). “Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia”. Nature Communications. 12 (1): 972. doi:10.1038/s41467-021-21240-1. PMC 7873279. PMID 33563978.
  4. ^ a b c Hul V, Delaune D, Karlsson EA, Hassanin A, Tey PO, Baidaliuk A, và đồng nghiệp (26 tháng 1 năm 2021). “A novel SARS-CoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia”. bioRxiv (bằng tiếng Anh). tr. 2021.01.26.428212. doi:10.1101/2021.01.26.428212.
  5. ^ a b Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, và đồng nghiệp (tháng 6 năm 2020). “A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein”. Current Biology. 30 (11): 2196–2203.e3. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. PMID 32416074.
  6. ^ Lam TT, Jia N, Zhang YW, Shum MH, Jiang JF, Zhu HC, và đồng nghiệp (tháng 7 năm 2020). “Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins”. Nature. 583 (7815): 282–285. doi:10.1038/s41586-020-2169-0. PMID 32218527.
  7. ^ Liu P, Jiang JZ, Wan XF, Hua Y, Li L, Zhou J, và đồng nghiệp (tháng 5 năm 2020). “Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)?”. PLoS Pathogens. 16 (5): e1008421. doi:10.1371/journal.ppat.1008421. PMID 32407364.
  8. ^ Zhou H, Chen X, Hu T, Li J, Song H, Liu Y, và đồng nghiệp (tháng 6 năm 2020). “A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein”. Current Biology. 30 (11): 2196–2203.e3. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. PMID 32416074.
Lấy từ “https://vi.wikipedia.org/w/index.php?title=Rc-o319&oldid=65267722”